南京海昌中药集团有限公司为南京中医药大学科技人员与南京高新技术经济开发总公司合作，于2008年6月在南京国家级高新技术产业开发区内成立的，以生产中药饮片、中成药及中药制药设备的产、学、研紧密结合的科技型企业。集团拥有南京海昌中药集团研发中心以及南京海源中药饮片有限公司（国家高新技术企业）、江苏海昇药业有限公司（国家高新技术企业）、杭州海善制药设备股份有限公司3家子公司，形成了较为完整的现代中药产业链。
集团公司为“国家中药现代化科技产业（江苏）基地”，是国家教育部中药炮制规范化及标准化工程研究中心及国家科技部中药饮片质量标准研究平台的共建单位、国家中医药管理局中药炮制标准重点研究室的产业化基地、国家标准化管理委员会全国中药炮制机械标准化分技术委员会依托单位、世界中医药学会联合会中药饮片质量专业委员会会长单位、中国医药物资协会中药饮片与设备联盟理事长单位；也是江苏省中药（饮片）规范化及产业化工程研究中心、江苏省中药现代化产学研联合培养研究生示范基地、江苏省企业研究生工作站、南京市中药质量检测与新产品开发公共技术服务平台、南京市中药丸剂现代工程技术研究中心、南京市现代中药资源开发与利用工程研究中心建设单位。
近5年来，集团公司先后获得了南京市科技进步一等奖、江苏省科技进步二等奖和国家教育部科技进步一、二等奖等科技奖励7项；先后被评为“江苏省优秀企业”、“江苏省中小企业创新能力示范企业”、“江苏省科技型中小企业”、“工信部两化融合管理体系评定单位”。2013年，集团公司董事长蔡宝昌教授并被评选为“南京市科技创业家”。2014年，被中国医药物资协会评为“最具投资价值医药企业”。
集团公司面向新兴的现代中药产业，从绿色中药材GAP基地建设，中药材产地加工及饮片炮制、中药炮制设备的智能化开发、优质中药饮片的研究，原创中药新药的研发等产业链的多个层面展开全面攻关，旨在建立优质中药饮片的生产体系、饮片质量标准评价体系及现代中成药的创新体系；进一步完善中药材产地加工及饮片炮制一体化设备等，生产国内外一流的优质中药饮片和现代中成药，争创产、学、研一体化的特色中药企业。
